Dr Vegapunk (Dr. ベガパンク, Dokutā Begapanku?) adalah ilmuwan terkemuka yang bekerja dibawah pihak pemerintah. Karyanya termasuk menemukan rahasia-rahasia seperti penggunaan Kairoseki, mengaplikasikan cara kerja kekuatan Buah Iblis, dan berbagai prestasi ilmiah lain yang dapat dikatakan setidaknya 500 tahun lebih cepat dari teknologi saat ini.
Dia berasal dari pulau musim dingin Pulau Karakuri. Meskipun belum pernah diperlihatkan dia berada dipulau tersebut. Vegapunk adalah pria tua dengan tinggi sedang , kaki ramping , dan pipi merah. Dia memiliki kepala yang terlihat memanjang tetapi diiris rapi dan memiliki poros yang digerakkan untuk menopang struktur yang menyerupai bagian atas apel dan daunnya.
Dahinya sangat lebar , lidahnya sangat panjang , sementara matanya dekat dengan hidung kentangnya. Ia memiliki kepala botak di bagian atas , namun memiliki rambut runcing di bagian samping , serta kumis yang tebal. Dia memakai baju luar dengan SSG di bagian belakang , kemeja polkadot , celana gelap dan sepatu DOM.
Ketika ia berusia 43 tahun, Vegapunk memiliki kepala yang membesar yang menutupi sebagian besar tinggi badannya dan rambutnya berwarna gelap dan menutupi sebagian kepalanya. Dia mengenakan jaket kulit , kemeja tipis , ikat pinggang , celana gelap dan sepatu formal.
Selain itu , dalam penjelasan Kuma tentang modifikasi Pacifista-nya, ia terlihat mengenakan sarung tangan kuning dan kemeja bergaris sambil mengenakan jas lab.
Di masa mudanya, ia adalah orang yang baik hati yang peduli terhadap penduduk di pulau Karakuri, dia bersedia membantu mereka dengan penemuannya. Ia merupakan kebanggaan dari pulau Karakuri. Para penduduk juga masih berharap dia untuk kembali. Dia menghormati keinginan rekan-rekannya, karena ia setuju menuruti permintaan terakhir Bartholomew Kuma.
Vegapunk memiliki pengawal bernama Sentomaru. Meski hubungan antara keduanya belum ditampilkan secara rinci.
Vegapunk tampaknya memiliki hubungan cukup baik dengan Kuma untuk memberinya keinginan terakhirnya sebelum menjadi wujud robot sepenuhnya. Dia meminta Dr.Vegapunk untuk memprogramnya untuk melindungi Thousand Sunny sampai kembalinya salah satu Kru Topi Jerami.
Hal ini sangat mungkin bahwa Vegapunk sangat menghormati kepribadian Kuma, karena itu ia mengubah Kuma menjadi prototipe Pacifista, dan ia membiarkan Kuma melakukan hal-hal yang bertentangan dengan Pemerintah Dunia, serta mengabulkan keinginan terakhirnya dengan memasukkan misi ke dalam pemogramannya sesuai yang Kuma minta.
Sedikit yang diketahui tentang hubungan Vegapunk dengan Caesar Clown, selain mereka dulu rekan dan saingan. Caesar dianggap menjadi ilmuwan terbaik kedua dari Vegapunk dan tampaknya dia menyimpan dendam terhadap Vegapunk. Empat Tahun lalu, Vegapunk sebagai ketua sains hendak mengeluarkan Caesar Clown karena dianggap selalu membuat percobaan-percobaan yang berbahaya(termasuk percobaan gas pembunuh masal).
Tidak terima dengan hal ini, Caesar mencoba mengaktifkan percobaan gasnya. Vegapunk sudah berusaha menghentikannya namun Caesar tetap mengaktifkannya sehingga Punk Hazard meledak dan dipenuhi oleh gas beracun buatan caesar membuat Punk Hazard menjadi daerah yang terlarang dimasuki.
 adalah ilmuwan terkemuka yang bekerja dibawah pihak pemerintah. Karyanya termasuk menemukan rahasia-rahasia seperti penggunaan Kairoseki, mengaplikasikan cara kerja kekuatan Buah Iblis, dan berbagai prestasi ilmiah lain yang dapat dikatakan setidaknya 500 tahun lebih cepat dari teknologi saat ini.){kind=link}